控制器除了控制电机运动外还要控制各种阀门信号。例如火焰切割机控制器要输出预热氧、快氧、三级穿孔等各种信号。等离子切割机控制器除了输出阀门信号外还要接受外界的比如等离子引弧回答信号和割枪防撞信号等输入信号。阀门开关的时间控制直接影响着加工工艺。因此如何协调各类输入输出信号，让各辅助功能真正地为切割服务，使切割的零件光滑整洁，也是评估一台控制器好坏的重要因素。信号的顺序、逻辑、定时控制都可以由PLC或者直接由计算机完成。市场上控制器一般有使用PLC和不使用PLC两种控制方式。

PLC即可编程逻辑控制器，它是一种数字运算操作的电子系统，采用可编程序的存贮器，用来在其内部存储执行逻辑运算、顺序控制、定时、计数和算术运算等操作的指令，并通过数字的、模拟的输入和输出，控制各种类型的机械或生产过程。搭载PLC的控制器将信号控制这部分交给PLC来管理，电机运动控制部分则交给计算机来管理，而往往PLC部分全都由切割机制造厂家完成，因此控制器可以做得通用化，这就要求切割机制造厂家具有一定的技术水平，由于各个机械厂家水平参差不齐，技术人员对于切割流程的熟悉程度也有很大差异，致使同样的控制系统产生的切割效果也各不相同，许多厂家制作的PLC排线又乱又复杂，一旦出错很难及时判断错误原因。

另一种信号控制方式不使用PLC，针对不同的要求，所有的工艺切割流程中的辅助功能全部由控制器软件完成。这样不但避免了复杂的PLC排线，又使得各类信号的输入输出与系统控制过程紧密地结合在一起，灵活又可靠，让各辅助功能真正为切割服务。